W związku ze zmianami w systemie kierowania i dowodzenia Siłami Zbrojnymi RP, Dowództwa Rodzajów Sił Zbrojnych w aktualnej formie funkcjonują tylko do końca 2013 roku.
- Od 1 stycznia 2014 roku powołane zostanie Dowództwo Generalne Rodzajów Sił Zbrojnych (DG RSZ), pod które będą podlegać jednostki będące aktualnie w podporządkowaniu dowództwom RSZ - informuje mjr Szczepan Głuszczak, rzecznik prasowy Grupy Organizacyjnej Dowództwa Generalnego Rodzajów Sił Zbrojnych. - W związku z powyższym 8 Flotylla Obrony Wybrzeża ze Świnoujścia będzie miała w swoim podporządkowaniu następujące jednostki wojskowe: 12 Dywizjon Trałowców, 13 Dywizjon Trałowców, 2 Dywizjon Okrętów Transportowo – Minowych, Komendę Portu Wojennego w Świnoujściu, 8 dywizjon przeciwlotniczy, 8 batalion saperów. Flotylla z Gdyni i ze Świnoujścia będą bezpośrednio podlegać pod DG RSZ.